飼料原料在儲存期間的品質不可能不發生變化，營養價值會隨貯存期的延長而降低。
1 儲存期間主要成分的變化
1.1 碳水化合物
飼料中主要的碳水化合物為淀粉，α和β淀粉酶與淀粉作用后將淀粉分解成糊精和果糖，在濕度75%以上的儲存初期，淀粉酶的作用會增加。由于淀粉酶的水解作用，水分的含量增加，飼料中的糖分經分解轉變成二氧化碳和水，干物質質量減少。總之，在高溫高濕環境下，碳水化合物發酵后，產生酒精及醋酸，除減低營養價值外，并使飼料發生一股酸味。
1.2 蛋白質
通常在儲存期，飼料中的粗蛋白質量不會變化，且可能略增。但蛋白質的溶解度和消化率會降低。同時雖然總蛋白質量增加，但是真蛋白質量是否增加，卻令人懷疑。因而含氮混合物較其他成分的變異緩慢，不易從飼料中流失，故換算粗蛋白質其氮含量便因此而略增。此外，除非飼料已達嚴重腐敗程度，蛋白酶水解蛋白質產生的反應通常很慢而不易測出。
飼料原料的成熟度對于氮的變化也有很大的影響。例如，玉米中的醇溶谷蛋白，如果玉米較成熟，則醇溶谷蛋白合成的速度較快，在總含氮量中，當可溶性非蛋白氮快速減少時，則醇溶谷蛋白氮便相對地快速增加，這表明可溶性蛋白氮混合物用來形成醇溶谷蛋白了。用成熟度不夠的谷物當原料，這種形成醇溶谷蛋白的現象就不會發生。
1.3 脂肪
飼料中脂肪的變化是因氧化導致腐壞、酸敗或因水解產生游離脂肪酸所致，在儲存時，脂肪酶分解脂肪而產生游離脂肪酸及甘油，尤其當溫度和濕度很高時，最易發生腐敗，此乃因霉菌衍生所致，霉菌中的脂化活動較強，為脂肪酶的主要來源。脂肪的水解速度較蛋白質和碳水化合物快，所以我們可以用飼料中游離脂肪酸含量，作為飼料是否腐敗的信號，飼料的酸敗可以用化學藥品（抗氧化劑）來防止。
1.4 礦物質、維生素及脂溶性物質
除非在特殊狀況下，通常飼料在儲存時，其礦物質量是不會發生變異的。維生素在儲存時會發生“流失”，一般而言，維生素E在儲存時流失量大，其流失程度與飼料中飽和脂肪酸含量有關，在有氧的環境下，儲存180天后，維生素E可流失62%，此外維生素A、D也易因氧化而減少含量。
2 儲存時應注意事項
2.1 溫度、昆蟲
昆蟲除了咬食、污染飼料外，還會引起溫度、濕度的提高。昆蟲對溫度的變化非常敏感，當溫度在 15。5℃或以下時，繁殖很慢，甚至停止；當溫度高達41℃或以上時，也不易存在，最適宜昆蟲繁殖的溫度為29℃左右，昆蟲的生活周期約30天左右，繁殖的非常快；一般發現蟲害時，可用熏蒸法消毒滅蟲。
2.2 濕度
隨濕度的提高，霉菌迅速繁殖，使倉庫中的溫度及濕度均提高，隨之霉味及酸味相繼出現，濕度以控制在65%以下為宜。
2.3 光線
飼料或養分常因光線而發生變異或因光線而加速其變化，光線對飼料變化具有催化作用。光線會引起脂肪氧化，破壞脂溶性維生素，蛋白質也因光線而發生變性。
2.4 氧氣
大氣中的氧能使脂肪氧化，影響蛋白質生物價值及破壞某些維生素，不僅影響養分，并降低適口性。
2.5 微生物
霉菌、細菌、酵母菌均可能因環境變化而迅速繁殖，降低原料的利用性，還可能產生毒素而引起中毒。
2.6 原料本身的性狀
如細度、pH值、完整性、均勻度、含水量、成熟度等，通常原料水分在13%以下便可抑制大部分微生物的生長，10%以下便可減少昆蟲的產生。
2.7 倉儲設備、管理
隔熱效果及儲存期均影響儲存期間的飼料原料品質變化，管理包括有蟲鼠的控制、通風、翻倉、先進先出等工作