原蟲病是由原生動物（原蟲）引起的寄生蟲病。原生動物是單細胞動物，其細胞結構主要由細胞核和細胞質兩部分組成，并且具有與多細胞動物相似的各種生理活動，如代謝、生殖、運動、感覺反應及各種適應性等等。原蟲的種類很多，形態各異，大小差別也很大，寄生性原蟲都是比較小的，肉眼看不到，有的只有1—2μm，有的達100多μm，平均都在50以下。寄生性原蟲病都是專性寄生蟲，對宿主有一定的選擇性。原蟲病包括球蟲病、弓漿蟲病、住肉孢子蟲病、血變原蟲病、住白細胞蟲病、、瘧原蟲病、組織滴蟲病、毛滴蟲病、鞭蟲病和錐蟲病等。但在臨床實踐中，最常見的是球蟲病、住白細胞蟲病、組織滴蟲病和弓漿蟲病。