抗生素所發(fā)揮的積極作用主要體現(xiàn)在防治水生動物疾病、促進生長、節(jié)約營養(yǎng)成分等方面。
但 是，由于抗生素的不斷使用容易產(chǎn)生耐藥菌株、存在藥物殘留以及容易破壞水生動物微生態(tài)平衡，一方面使得水產(chǎn)養(yǎng)殖疾病越來越難治；另一方面水產(chǎn)品質(zhì)量安全得 不到保證。
因此，為了人類的健康和水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展，必須充分認識到抗生素在水產(chǎn)養(yǎng)殖中所帶來的副作用。抗生素的副作用集中表現(xiàn)在以下幾個方面：
1、耐藥菌株的產(chǎn)生。某種曾經(jīng)有效的抗生素在生產(chǎn)上低劑量、長時間使用后，會出現(xiàn)藥效減弱或完全消失的現(xiàn)象，這是因為病原菌對抗生素產(chǎn)生的抗性或耐藥性，即產(chǎn)生了耐藥菌株。
2、在水產(chǎn)品中產(chǎn)生藥物殘留。抗生素使用后進入水生動物的血液循環(huán)，大多數(shù)會被排出體外，極少數(shù)則會殘留在體內(nèi)組織中，并且隨著多次使用在體內(nèi)蓄積起來。
3、破壞微生態(tài)平衡。抗生素的使用在抑制或殺滅病原微生物的同時也會抑制這些有益微生物，使水生動物體內(nèi)外微生態(tài)平衡被破壞，導(dǎo)致微生物惡化或消化吸收障礙而引起新的疾病。
4、對免疫系統(tǒng)有抑制作用。抗生素對免疫系統(tǒng)的作用主要表現(xiàn)為對吞噬細胞的抑制。一是抗生素直接影響吞噬細胞的功能；二是通過影響微生物而影響吞噬細胞對微生物的趨化、攝取和殺滅等功能。
抗生素在水產(chǎn)養(yǎng)殖疾病防治中雖然有較好的應(yīng)用效果，但是隨著人們生活水平的提高，對水產(chǎn)品的質(zhì)量安全意識不斷增強，抗生素利弊之間的矛盾 日益激化，已經(jīng)引起人們的普遍關(guān)注。
因此，為了生產(chǎn)無公害水產(chǎn)品，提升水產(chǎn)品質(zhì)量，應(yīng)該科學(xué)、合理地認識抗生素使用的利與弊，要謹慎使用抗生素，嚴禁使用 國家違禁的氯霉素、紅霉素、桿菌肽鋅、泰樂菌素、環(huán)丙沙星等抗生素藥物，以確保養(yǎng)殖水產(chǎn)品安全衛(wèi)生。